Identificación biomolecular y patogenicidad de Phytophthora, Pythium y Phytopythium aislados de raíz y suelo en cítricos (Citrus spp.)

Juan José Oviedo Quirós, Luz Leonor Mattos Calderón

Resumen


El objetivo de esta investigación fue identificar las especies de Peronosporales presentes utilizando métodos moleculares. Se recuperaron muestras de las raíces secundarias y suelo de ocho campos correspondientes a las cuatro principales regiones productoras a lo largo de la costa peruana (Piura, Lambayeque, Lima e Ica). Los Peronosporales se aislaron en medios de cultivo PAR, PARH y V8. La identificación molecular se realizó por amplificación de 730 - 820 pb de la región del espaciador transcrito interno (ITS) y de 563 pb de la región del citocromo oxidasa II (Cox II) del ADNr, usando cebadores ITS6/ITS4 y FM66/FM58 respectivamente. Los fragmentos amplificados se secuenciaron utilizando la metodología de Sanger y la reconstrucción filogenética se realizó con análisis bayesiano, utilizando dos millones de generaciones. Los resultados formaron grupos con las secuencias de especies similares depositadas en el GenBank, incluyendo: Phytophthora nicotianae, Phytopythium cucurbitacearum y Pp. vexans (aislados de raíz y de suelo), Ph. parsiana y Pythium splendens (aislados de raíz), Py. aphanidermatum, Py. ultimun, Py. deliense, Pp. amazonianum (aislados de suelo); además, se identificó una especie afín con Pythium guangxiense (aislado del suelo). Por otra parte, se realizaron las pruebas de patogenicidad cumpliendo con los postulados de Koch para cada uno de los aislamientos obtenidos, resultando patogénicos Ph. nicotianae, Ph. parsiana y Pp. vexans.

Palabras clave


Cítricos; Phytophthora; Pythium; Phytopythium; Identificación Biomolecular; ITS; Cox II; Análisis Bayesiano.

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